Compétences scientifiques

Microbiologie

  • Suivi de croissance
  • Dénombrement et identification bactérienne
  • Travail en conditions stériles
  • Microscopie optique
  • Utilisation de fermenteur

Biologie moléculaire

  • PCR, qPCR et RT-qPCR
  • Extraction et purification ARN / ADN / protéines
  • Détection de protéine par western blot
  • Construction de plasmides
  • Construction de mutants
  • RNA-seq
  • Protéomique (spectrométrie de masse)
  • Électrophorèse capillaire d’ARN et de protéines (Bioanalyzer 2100)
  • T-RFLP
  • Fusion transcriptionnelle

Bioinformatique

  • Analyse de séquences d’ADN et de protéines
  • Analyse de données « -omique »
  • Annotation de génomes bactériens (Plateforme MaGe du Genoscope)
  • Utilisation de base de données (NCBI, GenBank, Uniprot, …)
  • Construction « in silico » de plasmides et d’amorces PCR (SerialCloner)

Chimie / techniques analytiques

  • Dosage du chlorure (méthode Jorg-Bertau)
  • HPLC chromatographie d’exclusion stérique
  • Spectrométrie de masse MALDI en tandem (TOF / TOF)

Statistiques

  • Tests non paramétriques (Kruskal-Wallis, Wilcoxon)
  • Statistiques avec le logiciel R